Không kê khai hóa đơn đầu vào có bị phạt không?

Trả lời cho câu hỏi về rủi ro xử phạt Không kê khai hóa đơn đầu vào có bị phạt không (tương ứng Chỉ tiêu 23, 24 trên Tờ khai 01/GTGT), dưới đây là phân tích dựa trên quy định pháp luật hiện hành và thực tiễn thanh tra, kiểm tra thuế.

Thảo luận Topic tại: https://www.facebook.com/groups/congvanketoan/

Theo quy định mới tại Điểm đ Khoản 1 Điều 14 Luật Thuế GTGT có hiệu lực thi hành từ ngày 01/07/2025, thuế GTGT đầu vào phát sinh trong tháng, quý nào thì được kê khai, khấu trừ trong tháng, quý đó. Luật mới đã làm rõ cách xử lý khi phát hiện kê khai sai, sót hóa đơn đầu vào:

Người nộp thuế được kê khai bổ sung tại kỳ phát hiện sai sót nếu việc này chỉ làm giảm số thuế phải nộp hoặc chỉ làm thay đổi số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau.
Người nộp thuế phải kê khai bổ sung tại kỳ phát sinh nếu việc sai, sót làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế được hoàn.

Dựa trên nguyên tắc này, việc kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào về bản chất vẫn là quyền lợi. Pháp luật không coi đây là nghĩa vụ bắt buộc nếu việc không kê khai không dẫn đến hậu quả làm thiếu số thuế phải nộp của ngân sách Nhà nước. Nếu doanh nghiệp nhận hóa đơn hợp pháp nhưng quyết định không kê khai lên Chỉ tiêu 23, 24, hành vi này không gây thất thu thuế thì doanh nghiệp chỉ tự chịu thiệt thòi về mặt tài chính do mất quyền khấu trừ thuế GTGT đầu vào.

Ví dụ mẫu yêu cầu giải trình chênh lệch giữa hệ thống hóa đơn điện tử và khấu trừ thuế GTGT đầu vào tờ khai 01/GTGT